ANALISIS DOCKING MOLEKULER BESERTA PREDIKSI ADME SENYAWA DERIVAT FLAVONOID SEBAGAI INHIBITOR ENZIM 15-LIPOXYGENASE-2
Abstract
Derivat flavonoid merupakan metabolit sekunder dari polifenol dan banyak ditemukan pada tumbuhan serta makanan dengan berbagai aktivitas biologi seperti antivirus dan antiinflamasi. Analisis docking molekuler senyawa derivat flavonoid terhadap enzim 15-lipoxygenase-2 bertujuan untuk menyelidiki potensi senyawa derivat flavonoid sebagai penghambat enzim 15-lipoxygenase-2 menggunakan program AutoDock Vina berdasarkan energi bebas pengikatan (ΔG), nilai RMSD, interaksi residu asam amino, serta prediksi ADME yang memenuhi kriteria dari Aturan Lipinski. Hasil docking dari tujuh senyawa derivat flavonoid ditemukan lima senyawa yang berpotensi sebagai penghambat 15-lipoxygenase-2 berdasarkan energi bebas pengikatan (ΔG), nilai RMSD, dan asam amino yang berkontribusi terhadap interaksi dengan ikatan hidrogen asam amino Leu, Ile, Phe, Asn dimana interaksi tersebut mirip dengan interaksi senyawa XRP yang merupakan ligan asli protein target yaitu epicatechin, epicatechin 3 gallat, luteolin, luteolin 7 glukosidase, dan quercetin. Prediksi nilai ADME pada penelitian ini menggunakan program SwissADME di mana tujuh senyawa derivat flavonoid memiliki berat molekul, nilai donor maupun akseptor ikatan hidrogen, dan nilai log P yang memenuhi kriteria dari Aturan Lipinski.
Downloads
References
Srikandi ardiansyah, e. E. P., herda ariyani & hendera. Studi literatur efek penggunaan non-steroidal anti inflammatory drugs (nsaid) pada sistem gastrointestinal (literature study of the non-steroidal anti inflammatory drugs (nsaids) on the gastrointestinal system). J. Curr. Pharm. Sci. 5, 418–428 (2021).
Syahputra, E., Marai Rahmawati & Said Imran. Pengaruh Komposisi Media Tanam dan Konsentrasi Pupuk Daun Terhadap Pertumbuhan dan Hasil Tanaman Selada (Lactuca sativa L.). J. Floratek 9, 39–45 (2014).
Listyani, T. A. & Herowati, R. Analisis Docking Molekuler Senyawa Derivat Phthalimide sebagai Inhibitor Non-Nukleosida HIV-1 Reverse Transcriptase. J. Farm. Indones. 15, 123–134 (2018).
Chairunisa, F., Safithri, M., Andrianto, D., Kurniasih, R. & Irsal, R. A. P. Molecular Docking of Red Betel Leaf Bioactive Compounds (Piper crocatum) as Lipoxygenase Inhibitor. Indones. J. Pharm. Sci. Technol. 10, 90 (2023).
Tsai, W. C. et al. Kinetic and structural investigations of novel inhibitors of human epithelial 15-lipoxygenase-2. Bioorg. Med. Chem. 46, 116349 (2021).
Saputri, K. E., Fakhmi, N., Kusumaningtyas, E., Priyatama, D. & Santoso, B. Docking Molekular Potensi Anti Diabetes Melitus Tipe 2 Turunan Zerumbon Sebagai Inhibitor Aldosa Reduktase Dengan Autodock-Vina. Chim. Nat. Acta 4, 16 (2016).
Listyani, T. A. et al. In silico adme and toxicity studies of derivative phthalimide compounds as non-nucleoside hiv-1 reverse transcriptase inhibitor. 3, 17–26 (2022).
